- En noviembre de 2001, la jueza Flora Sepúlveda procesa a siete jóvenes por obstrucción a la justicia, en el marco de la tesis de la PDI (golpiza en el estacionamiento).
- En 2002, Carabineros sindica como culpable de la desaparición al dueño de La Cucaracha, Bruno Betanzo, por golpearlo al interior del local. Por años, esta tesis y la elaborada por la PDI serían confrontadas en los tribunales.
- En febrero de 2004 el cuerpo de Jorge Matute es encontrado en la Ruta de la Madera.
- En 2005 se realizan los funerales de Jorge Matute.
- En 2008 el magistrado Juan Rubilar, que había reemplazado a Sepúlveda, sobresee la causa.
- En 2009 el juez Rubilar la reabre solo por un mes, sin adoptar resoluciones de importancia.
- En enero de 2014 la causa se reabre para exhumar el cuerpo de Matute. El SML concluye que murió asesinado por una golpiza. El nuevo juez a cargo de la causa, Jaime Solís, se inhabilita por estar emparentado con uno de los sospechosos.
- En junio de 2014 Carola Rivas asume la causa y ordena una "reingeniería" del expediente.
- En noviembre de 2014, en una segunda autopsia, se concluye que la golpiza no existió. Meses después (enero de 2015) se informa que se encontró un fármaco en su cuerpo.
- En 2015, entre enero y noviembre, se comprueba que la sangre encontrada en La Cucaracha no correspondía a Jorge Matute, y la ministra Rivas detecta inconsistencias, contradicciones y hechos falsos entre los informes de la PDI.
- En 2016, la ministra descarta también la hipótesis que vinculaba la muerte de Matute con un cartel de narcotraficantes de Coronel y a un posible secuestro.
- En 2016 y 2017 la ministra determina que la tesis de la golpiza no existió, pues no hubo evidencia científica que la avale. Sí centra su atención en la presencia del fármaco.
- Marzo de 2018, Rivas informa a la familia sobre la hipótesis de la droga y abuso sexual.
