iOS 10 permite una mejor relación del sistema con apps de mensajería. Por ejemplo, ahora las llamadas de audio entrantes de WhatsApp serán mostradas como cualquier otra que llega al teléfono, con el mismo botón para aceptarlas o rechazarlas. También, a través de la última versión de WhatsApp para iPhone, se pueden enviar mensajes o iniciar llamadas de WhatsApp a través de Siri. Si esto se combina con el comando "Oye Siri", que permite iniciar el contacto con la asistente digital, ahora se puede usar WhatsApp sin tener que tocar el teléfono.
Muchos usuarios reemplazan las apps que vienen por defecto en iPhones y iPads con otras alternativas, y por primera vez, iOS permite borrar muchos de los programas de Apple. Así, ahora se pueden eliminar apps como "Bolsa", "Brújula", "Música" o "Clima" (después, si se quiere recuperarlas, se puede acceder a ellas en la App Store). Pero hay algunas, como "Buscar mi iPhone", "Wallet" y "Safari", que no entregan esta opción.
Uno de los cambios más importantes en iOS 10 está en la pantalla de inicio, antes de desbloquear el teléfono. El clásico mensaje "desliza para desbloquear" ya no aparece, porque a cada lado de la pantalla inicial ahora hay nuevas funciones. A la derecha se ubica un rápido acceso a la cámara, que facilita la captura de fotos y videos sin tener que desbloquear el teléfono. A la izquierda se encuentra un nuevo menú de widgets, y a propósito de eso...
El nuevo menú de widgets, disponible a la izquierda de la pantalla de bloqueo y del menú de apps, permite sumar pequeños cuadros de información de distintas aplicaciones. El de Waze es el de los más útiles: si el usuario tiene registrada su dirección de domicilio o de su trabajo, el widget permite saber cuánto se demorará en el traslado sin tener que abrir la app.
La app de Mensajes de Apple recibió uno de los mayores cambios, sumando stickers, su propia tienda de aplicaciones y animaciones para mensajes. Pero también incluyó una función escondida: la posibilidad de enviar mensajes manuscritos. Para acceder a esto sólo se tiene que poner la pantalla en orientación horizontal al escribir un mensaje, y automáticamente aparecerá un cuadro blanco para que el usuario "escriba en la pantalla". También se incluyen alternativas listas para mensajes rápidos.