La DINA funcionó hasta agosto de 1977, año en que se creó en su reemplazo la Central Nacional de Informaciones (CNI) por el Decreto Ley N° 1.878. Este organismo continuó la labor represiva de la DINA, organismo que había sido condenado internacionalmente, y durante su existencia se transformó en el servicio de inteligencia más importante del Estado.
La CNI fue disuelta por la Ley N° 18.943 el 22 de febrero de 1990, días antes del traspaso del mando militar al gobierno democrático de la Concertación. Gran parte de su personal civil fue incorporado a la planta del Ejército, al cual también pasaron sus activos y pasivos.
Según cifras entregadas por el gobierno militar y registradas por la Vicaría de la Solidaridad, entre 1973 y 1975 hubo 42.486 detenciones políticas, a las que se suman -según datos del organismo eclesiástico- 12.134 detenciones individuales y 26.431 detenciones masivas en el período 1976-1988, así como 4.134 situaciones de amedrentamiento entre 1977 y 1988 con 1.008 detenidos desaparecidos y 2.100 muertos por causas políticas.
El tema de los derechos humanos fue retomado por el gobierno de Patricio Aylwin. El 21 de mayo de 1990, el nuevo Presidente formó la "Comisión de Verdad y Reconciliación", encabezada por el jurista Raúl Rettig, cuya misión fue investigar los delitos de lesa humanidad cometidos durante el gobierno militar.
En 1996, el "Informe Rettig" y la Corporación Nacional para la Reconciliación y Reparación, creada el 3 de enero de 1992, para continuar el trabajo de la Comisión Rettig, concluyó que:
- Un total de 3.197 personas murieron o desaparecieron entre el 11 de septiembre de 1973 y el 11 de marzo de 1990, a consecuencia de violaciones a los derechos humanos en manos de agentes represivos del Estado.